Domėjimosi sritys: skydliaukės ir prieskydinių liaukų gerybinių ligų diagnostika; skydliaukės piktybinių ligų diagnostika ir histologinis patvirtinimas (biopsija), gydymo plano nustatymas ir aptarimas, pooperacinių pacientų stebėsena. Priekinės pilvo sienos bei pooperacinių išvaržų diagnostika ir gydymas, tulžies pūslės ligų diagnostika ir gydymas, odos ir poodžio gerybinių ir piktybinių darinių šalinimas. Atlieka: biopsijas, darinių šalinimą radijo dažnio technologijomis, įvairias chirurgines operacijas ir echoskopinį ištyrimą.
Gydytoju chirurgu A. Ostapenko dirba nuo 1983 metų. Išsilavinimą įgijo Vilniaus universiteto Medicinos fakultete. Yra atlikęs virš 5 000 operacijų. Yra vienas iš endokrininės chirurgijos bei minimaliai invazinės chirurgijos pradininkų Lietuvoje. Aktyviai dalyvauja studentų ir rezidentų mokslinėje ir praktikinėje veikloje Vilniaus universiteto Santaros klinikose.
Patyręs gydytojas nuolat tobulina savo kvalifikaciją, kasmet dalyvauja nacionalinėse ir tarptautinėse konferencijose bei seminaruose.